市役所の組織(平成29年4月1日現在)

総務管理部

総務管理課 （オンブズパーソン事務局、公文書センター）/行政改革推進課/ 秘書課 / 広報対話課 / 人事課 

企画政策部

企画政策課/上越市創造行政研究所/新水族博物館整備課/新幹線・交通政策課（上越妙高駅周辺整備事務所）

財務部

財政課/用地管財課（財産運用室）/契約検査課/税務課/収納課

防災危機管理部

市民安全課（原子力防災対策室）/危機管理課

自治・市民環境部

自治・地域振興課（南部・中部・北部まちづくりセンター）/各総合事務所/共生まちづくり課（人権・同和対策室、男女共同参画推進センター）/文化振興課/市民課（南・北出張所、市民相談センター、消費生活センター）/環境保全課/生活環境課

健康福祉部

福祉課 /高齢者支援課 /健康づくり推進課 （地域医療推進室、安塚・大島・牧・吉川・清里診療所）/国保年金課 /保育課/こども課/すこやかなくらし包括支援センター （こども発達支援センター）/福祉交流プラザ

産業観光部

産業振興課（商業・中心市街地活性化推進室、上越ものづくり振興センター、女性サポートセンター）/産業立地課 /観光振興課（施設経営管理室）

農林水産部

農政課 / 農村振興課 /農林水産整備課

都市整備部

都市整備課 / 道路課（雪対策室） / 河川海岸砂防課/ 建築住宅課（営繕室） /生活排水対策課（下水道センター） / 下水道建設課

会計課

教育委員会

教育総務課 / 学校教育課（教育センター） /社会教育課（公民館、高田図書館、直江津図書館、直江津学びの交流館、上越科学館、青少年健全育成センター） /文化行政課（総合博物館、小林古径記念美術館）/ 体育課 

行政委員会等

議会事務局 / 選挙管理委員会事務局 / 監査委員事務局 / 農業委員会事務局

ガス水道局

総務課 （経営企画室）/ 施設整備課（浄水センター、東部・北部・大潟区・中郷区・南部営業所） / 建設課 / 維持管理課